El avión es la forma más rápida y mejor para llegar al Dodecaneso. La mitad de las islas del archipiélago poseen aeropuerto, tres de ellos, además, son internacionales (Rodas, Kos y Kárpathos). Numerosos vuelos desde Atenas y entre las islas facilitan la comunicación. Las compañías griegas que vuelan son Olympic Air (www.olympicair.com/) y Aegean Airlines (www.aegeanair.com/), ambas se han fusionado así que operan los mismos vuelos y precios.
Desde Atenas hay vuelos a Rodas, Kasos, Kárpathos, Kos, Kálimnos, Leros y Astipálea.
Desde Rodas vuelos a Kos, Kárpathos, Kálimnos, Leros, Astipálea y Kastellórizo.
La compañía Sky Express enlaza Atenas, Astipálea,Kálimnos, Kárpathos, Kasos y Rodas. A Kasos también se llega desde Heraklion y Sitia, en Creta con la misma compañía.
Es importante reservar con bastante antelación los vuelos domésticos, sobre todo si se vuela a una isla pequeña (Leros, Kastellórizo, Astipálea), ya que se suelen agotar pronto. Si se compran con bastante tiempo se pueden conseguir precios muy interesantes.
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